Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNL3

Stk40, Serine/threonine-protein kinase 40, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk40Q7TNL3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stk40Q7TNL3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms