Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HhipQ7TN16 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HhipQ7TN16 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms