Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Shq1Q7TMX5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms