Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TwistnbQ78WZ7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms