Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vma21Q78T54 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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