Protein–RNA interactions for Protein: Q71B07

Dpy19l3, Probable C-mannosyltransferase DPY19L3, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpy19l3Q71B07 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Dpy19l3Q71B07 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dpy19l3Q71B07 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dpy19l3Q71B07 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dpy19l3Q71B07 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Dpy19l3Q71B07 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dpy19l3Q71B07 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dpy19l3Q71B07 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dpy19l3Q71B07 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dpy19l3Q71B07 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dpy19l3Q71B07 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dpy19l3Q71B07 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms