Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY3

Rps27l, 40S ribosomal protein S27-like, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27lQ6ZWY3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps27lQ6ZWY3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps27lQ6ZWY3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps27lQ6ZWY3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps27lQ6ZWY3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps27lQ6ZWY3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps27lQ6ZWY3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps27lQ6ZWY3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps27lQ6ZWY3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps27lQ6ZWY3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps27lQ6ZWY3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps27lQ6ZWY3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps27lQ6ZWY3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps27lQ6ZWY3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps27lQ6ZWY3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps27lQ6ZWY3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27lQ6ZWY3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms