Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SpopQ6ZWS8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms