Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RfflQ6ZQM0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms