Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NinlQ6ZQ12 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NinlQ6ZQ12 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms