Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ino80Q6ZPV2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms