Protein–RNA interactions for Protein: Q6X1Y6

Asic3, Acid-sensing ion channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic3Q6X1Y6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic3Q6X1Y6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Asic3Q6X1Y6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Asic3Q6X1Y6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Asic3Q6X1Y6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Asic3Q6X1Y6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Asic3Q6X1Y6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Asic3Q6X1Y6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Asic3Q6X1Y6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Asic3Q6X1Y6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Asic3Q6X1Y6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Asic3Q6X1Y6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms