Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ift172Q6VH22 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms