Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms