Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med16Q6PGF3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms