Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HjurpQ6PG16 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms