Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Scaf4Q6PFF0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms