Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gramd2bQ6PEM6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gramd2bQ6PEM6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms