Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf1cQ6PDZ2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms