Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6PD19 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6PD19 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6PD19 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6PD19 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6PD19 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6PD19 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6PD19 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6PD19 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6PD19 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6PD19 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6PD19 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q6PD19 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q6PD19 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q6PD19 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q6PD19 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q6PD19 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6PD19 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6PD19 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6PD19 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6PD19 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6PD19 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6PD19 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6PD19 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6PD19 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6PD19 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6PD19 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6PD19 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6PD19 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6PD19 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6PD19 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6PD19 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6PD19 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6PD19 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6PD19 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6PD19 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6PD19 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6PD19 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6PD19 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6PD19 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6PD19 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6PD19 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6PD19 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6PD19 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6PD19 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6PD19 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6PD19 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6PD19 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6PD19 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6PD19 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6PD19 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6PD19 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6PD19 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6PD19 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6PD19 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6PD19 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6PD19 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6PD19 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6PD19 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6PD19 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6PD19 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6PD19 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6PD19 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6PD19 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6PD19 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6PD19 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6PD19 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6PD19 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6PD19 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6PD19 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6PD19 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6PD19 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6PD19 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6PD19 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6PD19 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6PD19 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6PD19 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6PD19 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6PD19 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6PD19 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6PD19 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6PD19 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6PD19 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6PD19 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6PD19 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6PD19 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6PD19 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6PD19 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6PD19 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6PD19 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6PD19 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6PD19 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6PD19 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6PD19 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6PD19 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6PD19 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6PD19 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6PD19 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6PD19 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6PD19 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms