Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms