Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gapvd1Q6PAR5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gapvd1Q6PAR5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gapvd1Q6PAR5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gapvd1Q6PAR5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gapvd1Q6PAR5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gapvd1Q6PAR5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gapvd1Q6PAR5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gapvd1Q6PAR5 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gapvd1Q6PAR5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gapvd1Q6PAR5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gapvd1Q6PAR5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gapvd1Q6PAR5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gapvd1Q6PAR5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gapvd1Q6PAR5 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gapvd1Q6PAR5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gapvd1Q6PAR5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gapvd1Q6PAR5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Gapvd1Q6PAR5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gapvd1Q6PAR5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gapvd1Q6PAR5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Gapvd1Q6PAR5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gapvd1Q6PAR5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gapvd1Q6PAR5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gapvd1Q6PAR5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gapvd1Q6PAR5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms