Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8W9

Hmgb4, High mobility group protein B4, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb4Q6P8W9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hmgb4Q6P8W9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmgb4Q6P8W9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmgb4Q6P8W9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmgb4Q6P8W9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmgb4Q6P8W9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmgb4Q6P8W9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmgb4Q6P8W9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmgb4Q6P8W9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmgb4Q6P8W9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmgb4Q6P8W9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmgb4Q6P8W9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmgb4Q6P8W9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgb4Q6P8W9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgb4Q6P8W9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgb4Q6P8W9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgb4Q6P8W9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgb4Q6P8W9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgb4Q6P8W9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgb4Q6P8W9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgb4Q6P8W9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgb4Q6P8W9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgb4Q6P8W9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgb4Q6P8W9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgb4Q6P8W9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgb4Q6P8W9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgb4Q6P8W9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgb4Q6P8W9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgb4Q6P8W9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgb4Q6P8W9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgb4Q6P8W9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgb4Q6P8W9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgb4Q6P8W9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgb4Q6P8W9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgb4Q6P8W9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgb4Q6P8W9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgb4Q6P8W9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hmgb4Q6P8W9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms