Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W5

Tsen2, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen2, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsen2Q6P7W5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsen2Q6P7W5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms