Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6I6

Polr2m, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2mQ6P6I6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms