Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Smchd1Q6P5D8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Smchd1Q6P5D8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Smchd1Q6P5D8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smchd1Q6P5D8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smchd1Q6P5D8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smchd1Q6P5D8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smchd1Q6P5D8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smchd1Q6P5D8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smchd1Q6P5D8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smchd1Q6P5D8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smchd1Q6P5D8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smchd1Q6P5D8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smchd1Q6P5D8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smchd1Q6P5D8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smchd1Q6P5D8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smchd1Q6P5D8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smchd1Q6P5D8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smchd1Q6P5D8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Smchd1Q6P5D8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smchd1Q6P5D8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smchd1Q6P5D8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smchd1Q6P5D8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smchd1Q6P5D8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Smchd1Q6P5D8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smchd1Q6P5D8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smchd1Q6P5D8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Smchd1Q6P5D8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smchd1Q6P5D8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Smchd1Q6P5D8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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