Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frg2f1Q6P3A2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms