Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms