Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HelbQ6NVF4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HelbQ6NVF4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms