Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frem2Q6NVD0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frem2Q6NVD0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Frem2Q6NVD0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms