Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg16l2Q6KAU8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms