Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mvb12bQ6KAU4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms