Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sohlh1Q6IUP1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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