Protein–RNA interactions for Protein: Q6IME9

Krt72, Keratin, type II cytoskeletal 72, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt72Q6IME9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt72Q6IME9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt72Q6IME9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt72Q6IME9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt72Q6IME9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt72Q6IME9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt72Q6IME9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt72Q6IME9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt72Q6IME9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt72Q6IME9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt72Q6IME9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt72Q6IME9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt72Q6IME9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt72Q6IME9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt72Q6IME9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt72Q6IME9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt72Q6IME9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt72Q6IME9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt72Q6IME9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt72Q6IME9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt72Q6IME9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt72Q6IME9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt72Q6IME9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt72Q6IME9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt72Q6IME9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt72Q6IME9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt72Q6IME9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt72Q6IME9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt72Q6IME9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt72Q6IME9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt72Q6IME9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt72Q6IME9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt72Q6IME9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt72Q6IME9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms