Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Krt39Q6IFX4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt39Q6IFX4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt39Q6IFX4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt39Q6IFX4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt39Q6IFX4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt39Q6IFX4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt39Q6IFX4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt39Q6IFX4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt39Q6IFX4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt39Q6IFX4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt39Q6IFX4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt39Q6IFX4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt39Q6IFX4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt39Q6IFX4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms