Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg9bQ6EBV9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms