Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pdzrn3Q69ZS0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pdzrn3Q69ZS0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pdzrn3Q69ZS0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pdzrn3Q69ZS0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Pdzrn3Q69ZS0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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Pdzrn3Q69ZS0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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Pdzrn3Q69ZS0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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Pdzrn3Q69ZS0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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Pdzrn3Q69ZS0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pdzrn3Q69ZS0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pdzrn3Q69ZS0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pdzrn3Q69ZS0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
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