Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms