Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms