Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg9aQ68FE2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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