Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ino80dQ66JY2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms