Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q66JV7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q66JV7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q66JV7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q66JV7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q66JV7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q66JV7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q66JV7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q66JV7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q66JV7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q66JV7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q66JV7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Q66JV7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q66JV7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q66JV7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q66JV7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q66JV7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q66JV7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q66JV7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q66JV7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q66JV7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q66JV7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q66JV7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Q66JV7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q66JV7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q66JV7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Q66JV7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q66JV7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q66JV7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q66JV7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q66JV7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q66JV7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q66JV7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q66JV7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q66JV7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q66JV7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q66JV7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q66JV7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q66JV7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q66JV7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q66JV7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q66JV7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q66JV7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q66JV7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q66JV7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q66JV7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q66JV7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q66JV7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q66JV7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q66JV7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q66JV7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q66JV7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q66JV7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q66JV7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q66JV7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q66JV7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q66JV7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q66JV7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q66JV7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q66JV7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q66JV7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q66JV7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q66JV7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q66JV7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q66JV7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q66JV7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q66JV7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q66JV7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q66JV7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q66JV7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q66JV7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q66JV7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q66JV7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q66JV7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q66JV7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q66JV7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q66JV7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q66JV7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q66JV7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q66JV7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q66JV7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q66JV7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q66JV7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q66JV7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q66JV7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q66JV7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q66JV7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q66JV7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q66JV7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q66JV7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q66JV7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q66JV7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q66JV7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q66JV7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q66JV7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q66JV7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Q66JV7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q66JV7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q66JV7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q66JV7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms