Protein–RNA interactions for Protein: Q64697

Ptprcap, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcapQ64697 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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PtprcapQ64697 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprcapQ64697 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprcapQ64697 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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PtprcapQ64697 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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PtprcapQ64697 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprcapQ64697 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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PtprcapQ64697 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprcapQ64697 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprcapQ64697 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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PtprcapQ64697 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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PtprcapQ64697 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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PtprcapQ64697 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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PtprcapQ64697 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprcapQ64697 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprcapQ64697 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprcapQ64697 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprcapQ64697 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprcapQ64697 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprcapQ64697 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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PtprcapQ64697 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprcapQ64697 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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PtprcapQ64697 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms