Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Top2bQ64511 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Top2bQ64511 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms