Protein–RNA interactions for Protein: Q64455

Ptprj, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, mousemouse

Predictions only

Length 1,238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprjQ64455 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprjQ64455 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprjQ64455 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprjQ64455 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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PtprjQ64455 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprjQ64455 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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PtprjQ64455 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprjQ64455 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprjQ64455 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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PtprjQ64455 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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PtprjQ64455 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprjQ64455 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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PtprjQ64455 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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PtprjQ64455 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprjQ64455 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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PtprjQ64455 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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PtprjQ64455 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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PtprjQ64455 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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PtprjQ64455 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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PtprjQ64455 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprjQ64455 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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PtprjQ64455 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
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PtprjQ64455 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprjQ64455 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprjQ64455 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprjQ64455 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprjQ64455 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprjQ64455 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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