Protein–RNA interactions for Protein: Q64253

Ly6e, Lymphocyte antigen 6E, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6eQ64253 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ly6eQ64253 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ly6eQ64253 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ly6eQ64253 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ly6eQ64253 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ly6eQ64253 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ly6eQ64253 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ly6eQ64253 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ly6eQ64253 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ly6eQ64253 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ly6eQ64253 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ly6eQ64253 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ly6eQ64253 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ly6eQ64253 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ly6eQ64253 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ly6eQ64253 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms