Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms