Protein–RNA interactions for Protein: Q63934

Pou4f2, POU domain, class 4, transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f2Q63934 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f2Q63934 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f2Q63934 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f2Q63934 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f2Q63934 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f2Q63934 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f2Q63934 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f2Q63934 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f2Q63934 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f2Q63934 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f2Q63934 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f2Q63934 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f2Q63934 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f2Q63934 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f2Q63934 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f2Q63934 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f2Q63934 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f2Q63934 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f2Q63934 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f2Q63934 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f2Q63934 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f2Q63934 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f2Q63934 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f2Q63934 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f2Q63934 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou4f2Q63934 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms