Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift52Q62559 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms