Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lcn4Q62472 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lcn4Q62472 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lcn4Q62472 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms